彭綺華於80年代中後期加入電影圈，初時擔任副導演或製片的工作。1987年為陸劍明導演的《天官賜福》當副手。她還擔任過《吉屋藏嬌》(1988)、《打工狂想曲》(1989) 和《92應召女郎》(1992)的副導演。同一時間，她亦擔當製片的職位，例如《英雄好漢》(1987)、《夢過界》(1988)、《打工狂想曲》、《九一神鵰俠侶》(1991)等片。1990年，為《阿飛正傳》當製片，開始了跟王家衛的長期合作關係。

90年代初，彭綺華曾經執導過三齣梁家輝主演的電影，但她主要還是在製片、策劃、監製方面發展，是王家衛的重要拍檔，二人合作的作品包括《重慶森林》(1994)、《東邪西毒》(1994)、《墮落天使》(1995)、《春光乍洩》(1997)、《花樣年華》(2000)、《愛神》(2004)、《2046》(2004)、《藍莓之夜》(2007)、《一代宗師》(2013)等。彭綺華現任澤東電影有限公司的行政總監。