1957年5月29日出生於澳門，香港大學英國文學系畢業。1982年至1985年間，在英國國立電影電視學院進修導演編劇科，畢業作品《外國的月亮圓些？》(1985)，曾獲芝加哥影展銀牌獎。1985年回港後，加入香港電台電視部戲劇組，導演了二十多部單元劇，作品有《男燒衣》和《像我這樣一個女子》等。

1988年，轉往電影圈發展，首次執導劇情長片《我愛太空人》。翌年拍攝李碧華編劇的《潘金蓮之前世今生》。1992年，以《秋月》奪得瑞士羅伽諾影展金豹獎，以及歐洲藝術影院協會最佳電影獎。1993年的《誘僧》，在威尼斯影展參與競賽，並於1994年的法國克雷泰伊影展獲最佳電影獎。

1995年，和夫婿方令正移居澳洲，並繼續執導電影。1996年，以《浮生》獲經羅伽諾影展銀豹獎，以及西班牙希洪影展最佳影片及最佳導演獎。2000年，以《遇上1967的女神》奪得威尼斯影展最佳女主角獎，芝加哥影展最佳導演獎。2004的《給亞里的信》，被選為澳洲電影史一百部最佳影片之一。2008年，再在中港兩地拍攝華語電影《如夢》。

羅卓瑤長期與方令正合作，絕大多數作品都由後者監製和編劇。2010年，拍成短片《赤地》。